美國丹佛國際人類遺傳學展覽會是一項為期兩個半天(東部時間 4 月 8 日和 9 日上午 9 點至中午 12 點)的純數(shù)字活動,主要討論癌癥遺傳學和基因組學的最新發(fā)展。
《信使報》最近對克勞迪婭?卡瓦略博士進行了專訪??ㄍ呗圆┦渴翘窖笪鞅毖芯克ㄍ呗詫嶒炇业闹硌芯繂T,在那里,她的團隊研究罕見疾病的遺傳病因,以及影響疾病表現(xiàn)的基因組變異的形成生物學機制。她已加入美國人類遺傳學會(ASHG)15 年,在訪談中她談到了自己為何將該學會視為自己的專業(yè)歸屬,以及該學會是如何為她的工作營造出協(xié)作環(huán)境的??ㄍ呗圆┦磕壳笆敲绹祟愡z傳學會會員參與委員會的成員。除了這篇文章,大家還可以觀看一段關(guān)于卡瓦略博士會員經(jīng)歷的短視頻。
ASHG:跟我們講講你的研究以及你實驗室的研究重點吧。
克勞迪婭?卡瓦略(CC):我的實驗室致力于明確人類遺傳疾病的突變譜。我們尤其關(guān)注那些主要影響兒童的罕見疾病。僅在美國,就有約 1200 萬至 1500 萬兒童患有罕見疾病,其中大多數(shù)是遺傳性的。盡管患者數(shù)量眾多,但仍有數(shù)以百萬計的患兒未得到確診,許多遺傳疾病的分子病因也依舊未知。
突變在基因組中普遍存在,這使得每個生物體都獨一無二。我們研究致病性 DNA 變異的分子特征和起源,特別是那些會導致出生缺陷和神經(jīng)發(fā)育疾病的變異。我們探究某些類型的 DNA 變異如何影響局部基因組結(jié)構(gòu),有時還會帶來表觀遺傳學方面的影響。我們的研究揭示了易發(fā)生變異的區(qū)域的特性,并且發(fā)現(xiàn)了那些容易出錯的、導致新生變異形成的 DNA 修復機制。重要的是,通過識別生殖細胞和體細胞中的突變模式,我們揭示了一些共同的分子特征,這些特征有助于預測與生物學功能(以及功能障礙)相關(guān)的情況,從而為研究假設(shè)提供依據(jù),并為潛在的治療靶點提供信息。
美國人類遺傳學會(ASHG):你加入美國人類遺傳學會已經(jīng) 15 年了。是什么因素影響了你,讓你決定選擇美國人類遺傳學會作為你的專業(yè)歸屬呢?
克勞迪婭?卡瓦略(CC):美國人類遺傳學會通過舉辦教育活動以及提供在委員會中擔任志愿者服務的機會,促進了社群參與度。作為這個全球性社群的一員,我獲得了獨特的社交機會,這些機會在我職業(yè)生涯的不同階段都給予了支持。此外,美國人類遺傳學會的年會是規(guī)模最大、且國際參與度最高的人類遺傳學科學會議之一。對于那些對科學參與和學習機會感興趣的青年實習研究人員來說,這是一場令人興奮的會議。
美國人類遺傳學會(ASHG):在你職業(yè)生涯里,你最喜歡的研究項目是什么呢?
克勞迪婭?卡瓦略(CC):調(diào)查那些導致罕見遺傳疾病的極罕見的新生變異。罕見病研究有著很強的轉(zhuǎn)化應用層面的意義,它能立即為患者家庭和臨床醫(yī)生帶來幫助,這使得這個研究領(lǐng)域非常值得投入,也很能激發(fā)動力?,F(xiàn)有研究方法的快速更新?lián)Q代,以及計算工具的不斷發(fā)展,再加上全球科學界積極合作的熱情推動,共同為有抱負的科學家們營造了一個非常棒的科研環(huán)境。我的實驗室正在運用多種新穎的測序技術(shù),去發(fā)現(xiàn)那些 “隱藏” 的 DNA 變異類型,而在幾年前,研究這些變異幾乎是不可能的。此外,像端粒到端粒(T2T)的 CHM13 基因組和新生基因組組裝等最近開發(fā)出來的資源,有助于在基因組的復雜區(qū)域(比如近端著絲粒染色體和著絲粒周圍區(qū)域)中發(fā)現(xiàn) DNA 的改變。能成為人類遺傳學領(lǐng)域的一員,我覺得當下是一個非常令人興奮的時期。
美國人類遺傳學會(ASHG):在你們實驗室的研究中,有沒有哪些新興的研究領(lǐng)域或技術(shù),你覺得特別有前景或者具有變革性意義呢?
實驗室工作人員克勞迪婭?卡瓦略(CC):我們的研究中有一個驚人的發(fā)現(xiàn),即在基因組疾病中,多個結(jié)構(gòu)變異以順式(cis)方式出現(xiàn)的頻率相對較高,這種情況通常被稱為復雜基因組重排(CGRs)。結(jié)構(gòu)變異(SVs)是指 DNA 發(fā)生的改變,會導致特定基因組片段的擴增或缺失、方向改變(倒位),或者通過 DNA 插入和易位而改變?nèi)旧w的位置。人們通常認為結(jié)構(gòu)變異是孤立發(fā)生的,新生變異事件是已知的導致遺傳疾病的風險因素。然而,我們的團隊已經(jīng)證明,不同類型的結(jié)構(gòu)變異可以在同一個遺傳事件中同時形成。例如,擴增可能與一個大片段的倒位同時產(chǎn)生,而這些結(jié)構(gòu)變異中的每一個都可能涉及到千堿基對或兆堿基對的片段。重要的是,由于復雜基因組重排(CGRs)僅通過一個分子事件就能給基因組結(jié)構(gòu)帶來大量的 DNA 變異,它們?yōu)槲覀兞私饨Y(jié)構(gòu)變異的形成機制提供了關(guān)鍵信息。正是因為這個原因,對它們的研究推動了方法學和計算技術(shù)的發(fā)展,因為研究它們往往需要長分子、高精度的測序方法、人工篩選以及新生局部組裝技術(shù)。這是一個很有前景的研究領(lǐng)域,它還能夠揭示基因組非編碼區(qū)域中的重要調(diào)控區(qū)域。
在神經(jīng)發(fā)育障礙和兒科疾病(如 MECP2 重復綜合征(MRXSL,人類孟德爾遺傳在線數(shù)據(jù)庫編號 #300260)和佩利茲厄斯 - 梅茨巴赫?。≒MD,人類孟德爾遺傳在線數(shù)據(jù)庫編號 #312080))中,復雜基因組重排(CGRs)導致的拷貝數(shù)變異占所有致病拷貝數(shù)變異的 28% 至 40%。對這些疾病的研究為我們深入了解生殖系 DNA 變異中復雜基因組重排的復發(fā)性模式提供了機制方面的見解,其中許多模式在體細胞變異中也同樣適用。最近,我們對更大規(guī)模的 MRXSL 患者隊列進行的研究揭示了復雜基因組重排與臨床癥狀和基因表達變異性之間的相關(guān)性。其他研究帕金森病患者大型家系中遺傳的復雜基因組重排的團隊發(fā)現(xiàn),影響 α- 突觸核蛋白(SNCA)基因的復雜基因組重排會促進疾病的進展??偟膩碚f,隨著我們采用長讀長測序技術(shù)來篩查未確診遺傳疾病家庭中的致病性 DNA 變異,復雜基因組重排作為遺傳疾病的一個重要致病因素,其影響正日益凸顯。
在癌癥方面,復雜基因組重排常常表現(xiàn)為染色體碎裂(chromothripsis),這是一種復雜的結(jié)構(gòu)變異,涉及數(shù)十到數(shù)百個斷點連接,有時與特征性的高水平基因組不穩(wěn)定性相關(guān),而這種不穩(wěn)定性有助于腫瘤逃避治療。在罕見病中,致病性的復雜基因組重排通常沒有那么復雜,能夠在細胞分裂過程中穩(wěn)定地傳遞,并且常常是新生形成的。這些特點使得對罕見病的研究成為了一個很有吸引力的模型,用于研究包括染色體碎裂在內(nèi)的復雜基因組重排的起源和分子特征。
美國人類遺傳學會(ASHG):你有沒有通過美國人類遺傳學會建立的聯(lián)系,與其他研究人員或?qū)嶒炇艺归_合作呢?
克勞迪婭?卡瓦略(CC):有的!罕見遺傳疾病的研究需要臨床醫(yī)生、研究人員、患者家庭以及罕見病宣傳倡導者們攜手合作。我們實驗室營造了一個非常好的協(xié)作環(huán)境,目前正在進行的許多合作項目,最初都是在美國人類遺傳學會支持的活動中開啟的。美國人類遺傳學會的年會是我們實驗室參與的主要活動之一,為了這個會議,我們會準備好展示并討論我們的最新研究成果,與會的還有我們來自國內(nèi)和國際的合作伙伴。
中國組展機構(gòu):盈拓展覽,以“服務至上,品質(zhì)為先”為宗旨,為中國外貿(mào)企業(yè)提供專業(yè)、高效的展覽服務。榮獲多項殊榮,備受信賴。
下屆展會時間:2025年04月08號~04月09號
展會行業(yè):科學